Епархия разделяется на благочиннические округа во главе с благочинными, назначаемыми епархиальным архиереем. Сегодня в Могилевской епархии 7 благочиннических округов.
Могилевская епархия объединяет 80 приходов, имеющих юридическую регистрацию, 2 монастыря (1 мужской и 1 женский). В Могилевской епархии совершают служение 85 священников, 9 диаконов.
Управляющим Могилевской епархией, ее правящим архиереем c 2002 года является архиепископ Могилевский и Мстиславский Софроний.
Органом управления епархией, согласно Уставу Русской Православной Церкви, является епархиальный совет. Председателем епархиального совета является Управляющий Могилевской епархией, архиепископ Могилевский и Мстиславский Софроний.
В состав епархиального совета входят:
- архиепископ Могилевский и Мстиславский Софроний — управляющий епархией;
- прот. Геннадий Пацевич — секретарь Могилевской епархии;
- прот. Вячеслав Ивашкевич — благочинный Мстиславского округа;
- священноинок Инокентий — благочинный Климовичского округа;
- прот. Николай Змушко — благочинный Чаусского округа;
- прот. Сергий Лобода — благочинный Могилевского городского округа;
- свящ. Андрей Рыбаков — благочинный Шкловского округа;
- прот. Андрей Выговский – благочинный Горецкого округа;
- прот. Николай Жук — благочинный Чериковского округ.
В состав епархиального суда входят:
- Протоиерей Андрей Купцов;
- Протоиерей Роман Выговский;
- Протоиерей Александр Ралюк;
- Протоиерей Анатолий Серединский;
Исполнительно-распорядительным органом епархии, находящимся под непосредственным руководством епархиального архиерея, является епархиальное управление, которое имеет свою канцелярию, бухгалтерию, архив и иные вспомогательные отделы, обеспечивающие разнообразные виды епархиальной деятельности.